本海はその殆どがユーラシア大陸と日本列島に取り囲まれた縁海であり、外洋には、宗谷海峡、津軽海峡、対馬海峡を経て通じる。外洋への出口はいずれも国際海峡である。最深部は日本海北東部にあり水深は約3,700mである。一様に深いと思われていた日本海の中央に浅所（大和堆）が発見され、その地形がおおよそながら明らかになったのは1924年のことである。大和堆の地質学的研究は、Tsuya（1932）、新野（1933）などに始まる。堆積物の柱状試料の採取は、1955年、旧ソ連のヴィチャージ号に始まり、その後、東大海洋研究所の白鳳丸（1969）、アメリカのコンラッド号（1969）、ビーマ号（1971、1975）などが続き、多くの試料がもたらされた。試料に含まれる微化石の群集解析と酸素・炭素などの同位体比の分析から、後期更新世以降の日本海の海況変遷が次第に明らかになってきた。
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